Das Stück Software, was man in die Elektronik läd, ist kompilierter C-Code. Den kann man zwar grundsätzlich dekompilieren, aber nur mit gewissem Aufwand und das Ergebnis wird nicht die config.h sein, die du erwartest.
Von daher: das ist erstmal nicht vorgesehen und man startet grundsätzlich mit der lokalen Kopie.
