La Prusa i3 Front & Rear

Dopo l'acquiso di una Prusa i3 RW e successivo montaggio seguendo l'istruzioni, mi sono accorto che esistono due diverse configurazioni dell'asse Y:
Una con motore ed endstop posizionati sulla parte frontale ed una col tutto posizionato nella parte posteriore.
La mia è stata montata "tutto avanti" ma mi sono accorto subito di aver problemi, prima con gli endstop (risolti grazie al vostro aiuto) e poi con la stampa che risulta specchiata.
A questo punto volevo chiedere se , prima di apportare modifiche al FW non si fa prima ad invertire meccanicamente l'intero asse Y senza "incasinare" marlin e togliendoci davanti l' endstop che oltre a dare fastidio e anche brutto?
Quali sono i pro e i contro?