Mi sembra molto strano, quando parli di scheda madre bruciata, cosa intendi?
in quale punto è bruciata?
Direi che potrebbe saltare la porta USB del PC , per via di un corto circuito
oppure se dall'altre parte, in qualche modo hai una tensione invertita tra positivo e negativo.
Ma la scheda madre dovrebbe reggere.
Se il problema comunque deriva da li, avresti credo Arduino che non dovrebbe funzionare.
